科学家建立历史上最大的磁共振数据库

郑明尤（Zheng Mingyue）是中国科学院上海医学研究所的研究人员，并开发了由大型语言模型推广的RMN数据提取工具。它可以自动从大型开放动作文献中提取核磁共振（NMR）的实验数据，并构建迄今为止最大的RMN数据库。 5月28日，相关研究发表在化学科学中。 NMR光谱法是化学研究中强大且广泛使用的技术之一，能够提供有关分子环境的详细信息，并且对结构 - 原子相互作用非常敏感。在过去的20年中，研究人员开发了多个数据库来存储1小时的NMR光谱和13C分子，但是这些数据库的大小仍然相对有限。 NMRextractor，由研究团队提出的，您可以自动从科学文献中提取重要信息，例如综合名称，NMR条件和化学NMR 1H/13C的iCal变化。根据该工具，研究人员构建了一个NMRBANK，其中包含225,809个NMR数据记录。为每个记录构建了每个记录，其中包含化合物的IUPAC名称，Smiles Remberor，1H/13C NMR化学移位，模型和元数据分配的置信得分，例如PMID文章和杂志的名称。分析结果表明，NMRBANK涵盖的化学空间大大超过了公共NMR发布集。研究小组说，提取过程是高度可扩展的，它支持新研究文档的自动处理，而NMRBank的可持续更新不仅增加了开放NMR数据的覆盖范围，而且还基于MRI和人工智能的预测，还建立了相关化学研究的数据库。相关文档中的信息：http：//doi.org/10.1039/d4sc08802f