第一个低成本SNP液相芯片成功开发了

低成本和高性能猪肉快照芯片的发展对于我国猪的分子繁殖和遗传分析非常重要。最近，中国农业大学动物科学和技术学院的教授丁·天贡（Ding Xiangdong）开发了第一批具有52,000个SNP站点的Pig 50k液相的芯片GBTS50K，其SNP检测率和个人检测率在0.997至0.998之间。相关研究工作正式发表在2025年第5号综合农业杂志（JIA）中。目标捕获序列基因分型技术（GBTS）具有固相芯片技术（高稳定性和可靠性）和测序技术（高灵活性和低成本）的优点。但是，GBTS技术尚未应用于猪肉SNP芯片。基于GBTS技术，第一个液态相chipda Pig 50k包含52,000个SNP站点：GBTS50K。研究小组选择了6032 BIG White，Chambai和Durok Pigs的10个玩猪肉农场，以评估GBTS50K的性能。结果表明，GBTS50K以SNP检测率和单个检测率为0.997-0.998，具有出色的基因分型性能，其基因分型一致性一致性系数和重复样本的相关性分别为0.997和0.993。 GBTS50K在遗传分析和分子繁殖方面表现出色。例如，对于两个重要的经济特征：高达100公斤的重量以及100千克的腰痛的年龄和厚度，GBTS50K的基因组选择精度大于当前广泛使用的固相芯片GGP-Apports的基因组选择精度。此外，GBTS技术可以检测SNP不能进行SNP多代码编码器站点，从而允许GBTS50K获得SNP SNP STESDAD（〜100K），而无需增加基因型的成本。这些SNP位点可用于选择单倍型基因组，以进一步提高选择的精度生长和生殖特性的基因组为2-6％。这项研究表明，GBTS50K可以成为猪的遗传分析和分子繁殖的强大工具，同时在另一支牛和家禽中经历液相芯片。这也表明可以提供引用供它们发生。丁·江东（Ding Xiangdong）是本文的对应作者，中国农业大学的硕士学生张Zipeng是第一作者。这项研究是由山东省的主要研究与开发，国家农业和工业技术体系以及该国的主要研发计划的资助。相关文档中的信息：https：//doi.org/10.1016/j.jia.2023.07.033